Juan Cortina, president för Mexikos Farm Council (CNA), berättade Reuters att han tycker att rättegångarna behövs för att få regeringen att backa.
"Tyvärr, Jag tror att det kommer att behövas juridiska utmaningar från alla människor som använder glyfosat och genetiskt modifierad majs, sa Cortina, och tillägger att han också förväntar sig att amerikanska exportörer vädjar till bestämmelserna i USMCA:s handelspakt för att förklara åtgärderna olagliga.
I slutet av förra året, den mexikanska regeringen publicerade ett dekret som förbjuder användningen av både GMO-majs och glyfosat under de kommande tre åren, argumenterar för både nuvarande hälsorisker och att ökad traditionell majsförsörjning på hemmaplan bör prioriteras.
Det vagt formulerade dekretet har genererat motstånd inom branschen över hela linjen plus frenesitiska lobbyinsatser som syftar till att uppmana tjänstemän att ompröva.
Cortina noterade att förra året växte Mexikos jordbrukssektor med cirka 2% trots den ekonomiska nedgången orsakad av coronavirus-pandemin, även när resten av ekonomin krympte kraftigt.
Mexikos blomstrande boskapssektor kan drabbas av en förlust av konkurrenskraft under importförbudet på grund av dess stora beroende av huvuddelen av cirka 17 miljoner ton årligen importerad gul majs, används för att göda kor, grisar och höns, och nästan allt av det levereras från amerikanska bönder som nästan uteslutande odlar GMO-varianter av spannmålen.
Cortina hävdar att regeringen måste presentera alternativ, och att bönder skulle välkomna dem om de är priskonkurrenskraftiga och lika effektiva.
CNA uppskattar att Mexikos boskapssektor står för cirka 40 % av landets jordbruksekonomi, värd cirka 24 miljarder dollar förra året.
"Många aspekter av dekretet måste förtydligas, " tillade Cortina. 
Branschkritiker har noterat att åtgärden inte skiljer mellan gul majs, används mest för djurfoder och andra industriella ändamål, och vit majs, som används i Mexiko för landets bastortillas. Landet är mestadels självförsörjande på vit majs.
Det definierar inte heller vilka produkter som ingår i det föreslagna förbudet mot GMO-majs för mänsklig konsumtion.
Cortina, som tog rodret för CNA förra månaden och är sedan länge chef för Mexikos sockerkammare, uppmanade beslutsfattare att fatta beslut "baserade på vetenskap, inte på ideologi."
Samtidigt som han hävdade att årtionden av forskning om genetiskt modifierade grödor som majs har visat att de är säkra, kritiker motarbetar att fröna förorenar inhemska majsstammar som skadar den biologiska mångfalden av grödan i Mexiko, där majs först domesticerades. Cortina försvarade också glyfosats meritlista.
Huvudproducenten av glyfosatbaserade ogräsmedel är tyska Bayer AG, som ärvde verksamheten från förvärvet av Monsanto 2018.
Tidigare den här månaden, Bayer nådde en uppgörelse på 2 miljarder dollar över framtida påståenden om att den populära ogräsdödaren orsakar cancer.
